La elevada mortalidad de murciélagos debida a los impactos de los parques eólicos ha suscitado preocupación en todo el mundo. Este fenómeno puede ser aún más grave en un país megadiverso con importantes lagunas de conocimiento como Brasil. Con el fin de crear una herramienta que ayude a reducir este conflicto, generamos un mapa de la sensibilidad de los murciélagos a los impactos de los parques eólicos y evaluamos las áreas de conflicto en los escenarios actuales y de expansión de este sector. Para ello, realizamos una modelización deductiva de la idoneidad del hábitat que nos permitió afinar la información sobre la distribución de estos animales en el país, y analizamos atributos funcionales y características del paisaje que están relacionados con el riesgo de impacto de estos desarrollos. Además, superpusimos la cartografía de sensibilidad con la ubicación de los parques eólicos presentes en el país y con las zonas de potencial eólico. Nuestros resultados mostraron que la región de Caatinga merece una atención especial en el escenario actual. Entre las áreas de conflicto, encontramos que el 0,5% de las áreas evaluadas representan sitios con alta sensibilidad y alto potencial eólico.