Con motivo del nacimiento de su sobrino, Mateo regresa al pequeño pueblo manchego en el que se crió, un lugar de atmósfera asfixiante en el que todo el mundo critica a los demás y los secretos y mentiras van de casa en casa. Allí se reencontrará con unos hermanos que apenas le conocen y que siempre lo verán como la oveja negra. Agobiado por el qué dirán y atormentado por sus recuerdos e inseguridades, es incapaz de disfrutar su estancia y solo encuentra refugio en su amistad con Vicky y en la presencia al otro lado del muro de su vecino y amigo de la infancia, Jaime, una especie de primer amor no correspondido. 'Nido de pájaros' habla de la homofobia en los pueblos y en el seno de las casas, pero sobre todo de la propia homofobia, la que se siente hacia uno mismo y de cómo superarla.