Os fungos entomopatogénicos causam normalmente infecção quando os esporos entram em contacto com o hospedeiro do artrópode. Em condições ideais de temperaturas moderadas e humidade relativa elevada, os esporos fúngicos germinam e rompem a cutícula do insecto através da degradação enzimática e da pressão mecânica para ganhar entrada no corpo do insecto. Uma vez dentro do corpo, os fungos multiplicam-se, invadem os tecidos do insecto, emergem do insecto morto, e produzem mais esporos. Epizootias naturais de fungos entomophthoralean tais como Entomophaga maimaiga (em traça cigana), Entomophthora muscae (em moscas), Neozygites fresenii (em afídeos), N. floridana (em ácaros), e Pandora neoaphidis (em afídeos) são conhecidos por causarem reduções significativas nas populações hospedeiras. Embora estes fungos fastidiosos sejam difíceis de cultivar em meios artificiais e não tenham potencial para serem vendidos como biopesticidas, continuam a ser importantes no controlo natural de algumas espécies de pragas. Fungos hipocleares como Beauveria bassiana, Isaria fumosorosea, Hirsutella thompsonii, Lecanicillium lecanii, Metarhizium acridum, M. anisopliae, e M. brunneum, por outro lado, são comercialmente vendidos como biopesticidas em múltiplas formulações em todo o mundo.